李洋，教授，博士生导师，现任东北林业大学计算机与人工智能学院副院长。长期从事人工智能与生物信息处理研究，聚焦生物序列大模型以及智能药物发现等。主持国家自然科学基金青年项目、面上项目、专项项目以及黑龙江省自然科学基金优秀青年项目等；参与国家自然科学基金原创探索计划、国家重点研发计划“生物与信息融合（BT与IT融合）”重点专项等国家级项目。在 Genome Biology、Advanced Science、Bioinformatics、Briefings in Bioinformatics 等期刊发表论文50余篇。现任中国计算机学会生物信息学专委会执行委员、中国人工智能学会生物信息学与人工生命专委会委员。

一、科研项目

(1) 国自然青年科学基金项目（B类），2026-01-01至2028-12-31，主持

(2) 国自然专项项目，2025-01-01至2025-12-31，主持

(3) 国自然原创项目，2025-01-01至2025-12-31，参与

(4) 国自然面上项目，2025-01-01至2028-12-31，主持

(5) 国自然面上项目，2023-01-01至2026-12-31，主持

(6)国家重点研发计划子课题，2025-01至2027-11，主持

(7) 黑龙江省自然科学基金优秀青年项目，2023-07至2026-04，主持

二、代表性论文

（1） Yang Li, Guanyu Qiao, Hongli Du, Xin Gao and Guohua Wang. scKGBERT: a knowledge-enhanced foundation model for single-cell transcriptomics[J]. Genome Biology, 2025, 26(1): 402.

（2） Yang Li, Mengli Gao, Jilong Bian, Kaiqi Zhao, Dan Li and Guohua Wang. OntoGene: knowledge-enhanced BERT for promoter identification[J]. Science China Information Sciences, 2025, 68(7): 170106.

（3） Yang Li, Youhan Sun, Xinyu Qin, Xin Gao and Guohua Wang. MGPT: A Multi-task Graph Prompt Learning Framework for Drug Discovery[J]. Advanced Science, 2025, 12(34): e06444.

（4） Ruiting Xu, Dan Li, Wen Yang, Guohua Wang and Yang Li*. Improving ncRNA Family Prediction Using Multi-Modal Contrastive Learning of Sequence and Structure[J]. Bioinformatics, 2024, 40(11): btae640.

（5） Guanyu Qiao, Guohua Wang and Yang Li*. Causal enhanced drug–target interaction prediction based on graph generation and multi-source information fusion[J]. Bioinformatics, 2024, 40(10): btae570.

（6） Tianci Wang, Guanyu Qiao, Guohua Wang and Yang Li*. PLiSAGE: enhancing protein-ligand interaction prediction with multimodal surface and geometry encoding[J]. Bioinformatics, 2025, 41(12): btaf608.

三、研究方向：人工智能驱动的生物大数据解析与智能挖掘

聚焦生物信息学与人工智能交叉前沿，面向基因组、转录组、单细胞组学及多组学等生物大数据，开展深度学习、基础模型与智能算法研究，探索复杂生命系统中的遗传规律、调控机制及疾病关联，推动人工智能技术在生命科学与生物医学领域的创新应用。

主要研究内容包括：

（1）面向生物组学数据的深度学习方法与智能算法；

（2）生物序列与单细胞数据基础模型；

（3）多组学数据融合与生物信息挖掘；

（4）疾病相关基因、调控网络与分子机制解析；

（5）人工智能辅助药物发现与精准医学研究。

四、研究生招生简介

（1）博士研究生招生

学位类型：学术学位博士 生物学（0710）-生物信息学（071006）

招生计划：团队每年招收生物信息学方向博士研究生1-2名。

招生对象：欢迎具有计算机科学、生物信息学、数学、生物学及相关专业背景，热爱机器学习、算法研发与生命科学研究的优秀硕士毕业生报考。

（2）硕士研究生招生

学位类型：

学术学位硕士 计算机科学与技术（0812）-计算机应用技术（081203）

专业学位硕士 电子信息（0854）-计算机技术（085404）

招生对象：欢迎具有较强自驱力和学习能力，对人工智能及前沿技术充满热情，并对机器学习、算法开发、生物信息学及交叉学科研究感兴趣的优秀学生报考。

五、联系方式

有意报考或希望进一步了解研究方向的同学，可通过电子邮件联系：

邮箱：yli@nefu.edu.cn